マルチを使用して中医学製剤の生薬材料を解読する

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May 20, 2023

マルチを使用して中医学製剤の生薬材料を解読する

Scientific Reports volume 12、記事番号: 5988 (2022) この記事を引用する 2523 アクセス 7 引用 2 Altmetric Metrics の詳細 ハイスループット シーケンス技術の急速な発展により、

Scientific Reports volume 12、記事番号: 5988 (2022) この記事を引用

2523 アクセス

7 引用

2 オルトメトリック

メトリクスの詳細

ハイスループットシーケンス技術の急速な発展に伴い、伝統的中国医学 (TCM) 製剤中の生物学的成分を評価するアプローチも進歩しました。 マルチバーコード配列決定アプローチを使用すると、理論的には、DNA が存在する限り、TCM 製剤からすべての生物学的成分を識別できます。 以前の研究では、いくつかの古典的な TCM 製剤の生物学的成分がこのアプローチに基づいて分析され、成功しました。 しかし、多様な TCM 製剤に対するこのアプローチの普遍性、感度、信頼性は依然として不明です。 この研究では、マルチバーコードシーケンスアプローチの具体的な評価のために、4つの代表的なTCM製剤、すなわちBazhen Yimu Wan、Da Huoluo Wan、Niuhuang Jiangya Wan、およびYou Gui Wanを選択しました。 ITS2 および trnL バイオマーカーに基づいて、これらの代表的な TCM 製剤中の処方薬草材料 (PHM) を検出することに成功しました (最小感度: 77.8%、最大感度: 100%)。 ITS2 に基づく結果も、種レベルでは trnL よりも高い信頼性を示しており、それらを組み合わせることでより高い感度と信頼性が得られる可能性があります。 マルチバーコード配列決定アプローチは、これら 4 つの代表的な TCM 製剤の解読において優れた普遍性、感度、信頼性を示しています。 オミクスビッグデータ時代において、この研究は医薬品の品質管理のより良いデジタル化と近代化に向けて、TCM調製のPHM分析にマルチバーコードシークエンシングアプローチを適用する上で間違いなく一歩前進した。

伝統的な中国医学 (TCM) 製剤は、中国の診療所で少なくとも 3000 年にわたって使用されてきました 1,2。 中国ではさまざまな病気の予防と治療に利用されており、ここ数十年で世界中でその人気が高まっています。 TCM 製剤は、多数の植物、動物由来、および/または鉱物材料で構成されています。 中国医学理論および中国薬局方 (ChP)3 の指針に従って、さまざまな薬効材料を粉砕または煮沸して混合し、蜂蜜または水と一緒に錠剤に成形して、TCM 製剤 (特許医薬品とも呼ばれます) を作ります。 近年、中医学製剤は広く使用されていますが、その安全性と有効性を確保するためには、素材や製造工程に特に注意を払う必要がある品質管理(QC)など、解決すべき課題が多くあります。 TCM の品質評価には、主に化学成分と生物学的成分の定性分析と定量分析が含まれます4。 現在の TCM 調製方法 QC は主に化学プロファイリング 4 (薄層クロマトグラフィー (TLC)5、高速液体クロマトグラフィー紫外線 (HPLC-UV)6、高速液体クロマトグラフィー質量分析法 (HPLC-MS など)) に基づいて評価されています。 )7)。 参照ハーブ材料または標的化合物と比較して、TLC および HPLC 方法は種の情報を取得できますが、特に遺伝学のハイブリッド種を識別する場合には十分な精度が得られず、誤った識別が発生し、ハーブ材料の製造中に生物学的汚染や異物混入が生じる可能性があります。収集と製造プロセス。 しかし、すべての組織に安定して存在する断片である DNA を利用すれば 8、薬草材料を種レベルで正確に識別できるため、より高いレベルの感度と信頼性が得られ、化学分析の欠点を補うことができます 9,10。

DNA バーコードに基づく生物学的成分分析の概念は Hebert によって提案されました 11。 チェンら。 彼らは最初に、薬用植物とその近縁種を特定するためにいくつかの候補 DNA バーコードを適用しました 12。 Coghlan らは、DNA バーコードを初めて使用して、TCM 製剤に絶滅の危機に瀕し、取引が制限されている動植物種の誘導体が含まれているかどうかを判定しました2。 2014 年に、Cheng らは、 らは、ITS2 および trnL バイオマーカーに基づくメタゲノムベースの方法を使用した、Liuwei Dihuang Wan (LDW) の生物学的成分分析を初めて報告しました 13。 その後、Yimu Wan (YMW)14、Longdan Xiegan Wan (LXW)15、Jiuwei Qianhuo Wan (JQW)16 など、DNA バイオマーカーに基づいた TCM 製剤の生薬に関する報告が相次いでいます。 興味深いことに、最近の研究では、Lianhua Qingwenカプセル19、Jinhua Qinggan顆粒19、Yiqi Qingjieハーブ化合物20など、新型コロナウイルス感染症191917,18の予防と治療に効果的である可能性のあるいくつかのTCM製剤が報告されています。 Lianhua Qingwen カプセルは、新型コロナウイルス感染症 (Lianhua Qingwen) カプセルが新型コロナウイルス感染症 (Lianhua Qingwen) の予防または治療に効果的である可能性があると報告されました。これは、カンゾウや Rhei Radix Et Rhizome などの生物学的成分によるものである可能性があります3。 同じ原理が、Jinhua Qinggan 顆粒と Yiqi Qingjie ハーブ化合物にも当てはまります。 これらの発見は、DNA バーコードアプローチを使用した TCM 製剤の生物学的成分分析の重要性を改めて強調しました。

 510 bp and the reads of trnL whose length is < 75 bp were removed. After that, we discarded the sequence whose average quality score was below 20 in every five bp sliding window along with the whole reads. The sequences that contained ambiguous base call (N), homopolymers over eight bases or primers mismatched, incorrect barcodes, were also removed from ITS2 and trnL datasets./p>